Nevydařený experiment s geneticky upravenými rostlinami způsobil katastrofu na zemi. Většina populace byla vyhlazena. Zbytky lidí se snaží přežít na zpustošené planetě. Nezbedný chlapec Agita potká dívku Tuulu, která žila v minulosti. Její otec zajistil, aby přežila...
Rok 1582. Generál Araki Murašige se vzbouří proti mocnému politikovi Odovi Nobunagovi. Spiknutí se však nezdaří a Murašige je nucen potupně uprchnout. Nobunaga oslavuje své skvělé vítězství nad generálem a začíná podezřívat ostatní své podřízené ze zrady a plánuje je...
Příběh začíná zhruba osm měsíců po skončení prvního filmu. Genjimu se blíží promoce na Suzuranu, ale věc, kterou musí vyřešit, je konkurence jiné školy - Housen Gakuen. Neboť příměří, jež do té doby přetrvávalo, bylo zrušeno. V čele s dravým Taigou Narumim Housen...
