V 19. století je vládou najat odborník na mořskou biologii, aby zjistil, co potápí lodě po celém oceánu. Jeho dcera ho následuje. V cestě jim stojí tajemný kapitán Nemo a jeho neuvěřitelná ponorka.
Jedné bouřlivé noci objeví posádka malé lodi v kanálu La Manche opuštěnou nákladní loď Mary Deare, která je unášena vlnami na otevřeném moři. John Sands s vidinou zisku za právo na záchranu se pomocí své posádky dostane na Mary Deare a začne opuštěnou loď prohledávat....
Roku 1840 havaruje na skalách téměř opuštěného ostrova ve Skotsku loď s třemi námořníky, kde je pár místních obyvatel přijme mezi sebe. Ale příběh o přežití námořníků teprve začíná, když odhalí podivnou minulost jednoho kdysi zabydleného ostrova.